[FoLUG] Consiglio su perl script... vorrei solo un'idea di come fare!
paolo siniselli
paolo_siniselli@yahoo.it
Mer 17 Ott 2007 01:40:56 CEST
Salve ho una tabella di questo tipo. Nella prima colonna ce' il cromosoma, nella seconda il numero del gene, nella terza il nome del gene, nella quarta la malattia+altre info.
Quello che vorrei e' uno script in perl che mi raggruppasse tutto per cromosoma.
In poche parole vorrei una riga per ciascun cromosoma raggruppando, il numero, il nome, la malattia separati per esempio da questo simbolo "|".
Quindi per esempio per il cromosoma 10p avrei:
10p 605988|605989|607499|603188 DCLRE1C, ARTEMIS, SCIDA|ERI|BULN|OB10P Omenn syndrome, 603554 (3) |Severe ecc.
Questa e' la tabella che vorrei sistemare, grazie (ovviamente quella vera e' + lunga : ) :
10p 605988 DCLRE1C, ARTEMIS, SCIDA Omenn syndrome, 603554 (3)
10p 605989 ERI Severe combined immunodeficiency, Athabascan type, 602450 (3)
10p 607499 BULN {Bulimia nervosa, susceptibility to} (2)
10p 603188 OB10P {Obesity, susceptibility to}, 601665 (2)
10p11.1 606808 MYO3A, DFNB30 Deafness, autosomal recessive 30, 607101 (3)
10p11.2 189909 TCF8, PPCD3 Corneal dystrophy, posterior polymorphous, 3, 609141 (3)
10p11.2 191195 MAP3K8, COT, EST, TPL2 Lung cancer, somatic, 211980 (3)
10p12 602409 AF10 Leukemia, acute T-cell lymphoblastic (3)
10p12 602409 AF10 Leukemia, acute myeloid, 601626 (3)
10p12.1 602997 CUBN, IFCR, MGA1 Megaloblastic anemia-1, Finnish type, 261100 (3)
10p12.1 608221 FLJ14813, THC2 Thrombocytopenia-2, 188000 (3)
10p12.1 607429 PDSS1, TPT, COQ1 coenzyme Q10 deficiency, 607426 (3)
---------------------------------
---------------------------------
L'email della prossima generazione? Puoi averla con la nuova Yahoo! Mail
Maggiori informazioni sulla lista
FoLUG